24 Ocak 1967`de Chicago`da doğmuş, Kore`li ailesi ile birlikte New York`da yaşamıştır. 15 yaşında yerel bir grup tarafından bas gitar çalmak için davet edilmeden önce 10 sene kadar keman çalmıştır. Liseden mezun olduktan sonra lise arkadaşı John Petrucci ile birlikte Berklee College of Music`de eğitimine devam ederken Mike Portnoy ile tanışmıştır. Bu üçlü klavyeci Kevin Moore ve vokal Chris Collins ile daha sonra Dream Theater olarak anılacak olan Majesty isimli grubu kurmuştur.
John Myung etkilendiği isimler arasında Chris Squire, Steve Harris, Geddy Lee ve Cliff Burton`ı saymaktadır.
