Bu liste, Japonya'daki şehirler listesidir. Japonya'da belirlenmiş şehir, çekirdek şehir, özel şehir ve şehir olmak üzere dört türde şehir bulunmaktadır.
Japonya'nın başkenti Tokyo 1943 yılına kadar şehir olup günümüzde hukuki olarak metropol statüsüne sahip prefektörlüktür. Tokyo'nun çekirdeğini oluşturan özel semtler şehirlere benzer bir idari statüye sahiptir.
