Güney Doğu Avrupa Üniversitesi, Makedonya'nın ilk özel üniversitelerden biri olup; ilkbahar'in 2001 yılında açılmıştır. Avrupa Güvenlik ve İşbirliği teşkilatı (AGIT), Makedonya'da bir özel lise kurulmasını tartışmışlar ve talep etmişlerdi. Bu görüşmelerden sonra Makedonya parlamentosu tarafından Yükseköğretim Kanunu tasarısını kabul edildi. Üniversitenin temellerine, Mart ayının 2001'de atıldı, altı ay sonra eğitime tamamen açlıdı. Kasım ayının 2002 yılı tarihinde Güney Doğu Avrupa Üniversitesinde 2250 öğrenci eğitim görürken, Ekim 2003'te ise öğrenci sayısı 3700'e yükseldi. Şimdi Güney Doğu Avrupa Üniversitesi üniversitesinde toplam 5200 öğrenci eğitim görüyor. ==Fakülteler== * Hukuk Fakültesi * Kamu yönetimi fakültesi * İşletme fakültesi : - Ekonomik Yönetim : - Finans Yönetimi * İletişim bilimleri ve Teknolojiler fakültesi : - İletişim Bilimleri (Medya ve İletişim) : - Bilgisayar Bilimleri (İletişim Teknolojileri) * Pedagoji fakültesi : - Arnavut dili bölümü ve çalışmaları : - Makedon dili bölümü ve çalışmaları : - İngiliz dili bölümü ve çalışmaları : - Alman dili bölümü ve çalışmaları : - Fransız dili bölümü ve çalışmaları
Yönetim ve çalışanlar
*Güney Doğu Avrupa Üniversitesi Rektörü : Dr. Alaydin Abazi *Mali konular rektörü : Dr. Abdülmenaf Beceti *Akademik konular rektörü : Dr. Zamir Dika * Araştirma konuları rektörü : Murtezan İsmaili * Genel Sekreter : Cevahir Mehmeti * Finans Direktörü : Afrim Yonuzi
