Kumamoto (Japonca: 熊本市 Kumamoto-shi), Japonya'nın Kumamoto prefektörlüğünün merkezi ve en büyük şehridir. Yüzölçümü 389.53 km² olan şehrin nüfusu 1 Mart 2010 tarihi itibarı ile 731,286'dır. Kumamoto 1 Nisan 1889 yılında kurulmuş olup 1 Nisan 2012 yılında belirlenmiş şehir statüsü almıştır.
Kumamoto, önemli bir ticari, kültürel ve üniversite eğitimi merkezidir. Şehre Mashiki kasabasında yer alan Kumamoto Havalimanı hizmet vermektedir.
