Makedonya Futbol Federasyonu (Makedonca: Фудбалска Федерација на Македонија / Fudbalska Federacija na Makedonija ya da ФФМ/FFM), Makedonya'da futbol faaliyetlerini yürütmek, bu konularda her türlü düzenlemeyi yapmak, kararlar almak ve uygulamakla yetkili kurumdur. Prva Мakedonska Fudbalska Liga, Kup na Makedonija ve Kuzey Makedonya millî futbol takımını organize eden kurumun merkezi Üsküp'tedir. 1949 yılında kurulan kurumun şu anki başkanı Ilco Gjorgioski'dir.
Kurum aşağıdaki organizasyonların ve kuruluşların yönetiminden sorumludur:
- Prva Мakedonska Fudbalska Liga
- Makedonya 2. Ligi
- Makedonya 3. Ligi
- Makedonya Bölgesel Ligleri
- Kup na Makedonija
- Kuzey Makedonya kadın futbol şampiyonası
- Kuzey Makedonya Kadınlar Kupası
- Kuzey Makedonya millî futbol takımı
- Kuzey Makedonya 21 yaş altı millî futbol takımı
- Kuzey Makedonya 19 yaş altı millî futbol takımı
- Kuzey Makedonya 17 yaş altı millî futbol takımı
- Kuzey Makedonya kadın millî futbol takımı
- Kuzey Makedonya millî futsal takımı
