Karintiya`da yaşayan Sloven azınlığa dahil olan Messner politik olarak aktif bir aileden gelmektedir. Babası Janko Messner savaştan sonra Karintiya`da Sloven Kurtuluş Cephesi üyesiydi. Makedonya kökenli annesi İkinci Dünya Savaşı sırasında Tito`nun partizanlarındandı.
Viyana Üniversitesi`ndeki Slav dilleri ve Germen dilleri eğitiminden sonra aynı üniversitede doktora yaptı. Daha sonra bir bilgisayar şirketinde çalışan Messner gazetecilik yapmaktadır.
Gençlik yıllarında politik olarak aktif olan Messner, Karintiya`da Sosyalist Ortaokul Öğrencileri Birliği`ne üyeydi. Bu birliğin dağılmasından sonra Komünist Öğrenciler Birliği`ne katıldı (KSV) ve Sloven Öğrenciler Klübü`nde aktif olarak çalıştı. Bu sürede 1989`a kadar yayınına devam eden Slovence öğrenci dergisi Kladivo`yu yayınladı. 1973`te KPÖ`ye katıldı. Sloven azınlıkla ilgili uluslar politikasında partiyle anlaşamadığı için 1987`de merkez komite üyeliği de dahil olmak üzere partideki tüm görevlerinden istifa etti. Partinin Graz`daki yenilenme kongresinden sonra KPÖ`nün yeniden yapılandırılmasına Klagenfurt`tan katıldı, partinin genel yönetimine seçildi ve yönetimde azınlıklar sözcüsü seçildi. 2006 Mart ayında görevinden ayrılan Walter Baier`in yerine genel başkan oldu. 2006 Genel Seçimleri`nde partinin ilk sıra adayıydı.
