Muzaffer Ender (d. 1932, Kırklareli) - (ö. 3 Aralık 1994), Türk siyasetçidir.
İstanbul Eğitim Enstitüsü Edebiyat Bölümü ve Türkiye ve Orta Doğu Amme İdaresi Enstitüsü mezunudur. Cide Ortaokulu Edebiyat Öğretmenliği, Trabzon, Mersin ve Kırklareli Ticaret Liseleri Öğretmenliği, Kırklareli Belediye Başkanlığı, Yazarlık, Danışma Meclisi Kırklareli Üyeliği (15 Ekim 1981 – 6 Aralık 1983) yapmıştır. Evli ve iki çocuk babasıdır.
