Avrupalılar'ın yerleşmesinden önce bölgede Tsimshian yerlileri yaşamaktaydı. Kent, 1910 yılında kurulmuştur.
Ekonomi büyük ölçüde balıkçılık, liman ve turizme dayanır.
Prince Rupert, 2.500 mm'nin üzerinde aldığı yağış nedeniyle Kanada'nın en ıslak kenti olma unvanına sahiptir ve "Gökkuşakları Kenti" olarak bilinir.
