Rockefeller Üniversitesi (İngilizce: The Rockefeller University), New York'ta bulunan özel bir yüksek lisans üniversitesidir. Öğretimde öncelik biyoloji ve tıbbi bilimlerdedir. Ayrıca üniversite, Amerika Birleşik Devletleri'ndeki en eski biyo-medikal, araştırma enstitüsüdür. 2018 itibarıyla, 37 Ulusal Bilimler Akademisi üyesini, 17 Ulusal Tıp Akademisi üyesini, 7 Lasker Ödülü sahibini ve 5 Nobel ödülü sahibini bünyesinde bulundurur. Ekim 2019 itibarıyla, toplam 36 Nobel ödülü sahibi kişi, Rockefeller Üniversitesi'nden öğrenim görmüş.
Üniversite, Manhattan'ın Yukarı Doğu Yakasında, York Bulvarı'ndaki 63. ve 68. caddeler arasında yer almaktadır. Richard P. Lifton 1 Eylül 2016'da üniversitenin onbirinci başkanı olmuş ve günümüzde de başkanlığına devam etmektedir. Üniversitenin "Rockefeller University Press" yayım kolu bugüne kadar Deneysel Tıp Dergisi, Hücre Biyolojisi Dergisi ve Genel Fizyoloji Dergisi'ni yayımladı.
