Türkiye Profesyonel İkinci Ligi 1998-1999, TFF 1. Lig'in 36. sezonudur. Türkiye Profesyonel İkinci Lig'in 1998-1999 sezonu sonunda Vanspor şampiyon ve Denizlispor ikinci olarak Turkcell Süper Lig'e yükselirken, Yükselme grubunda 3. olan Göztepe Play-off Maçları sonucunda Birinci Lig'e yükselen üçüncü takım olmuştur. Yükselme Grubu Puan Durumu Play-off Maçları } Play-off maçları sonucunda Göztepe Birinci Lig'e çıkmaya hak kazanan üçüncü takım oldu. Linkler } } } }
