== Amatör branşlar Basketbol Sezon boyunca istikrar yakalayamayan basketbol takımı İstanbul Ligi'nde 18 maçta 12 galibiyetle 42 puan topladı ve ligi dördüncü sırada bitirdi. Attığı 1286 sayıya karşı 1069 sayı yedi . Sonrasında 2-5 Mart 1961 tarihlerinde İstanbul'da düzenlenen Federasyon Kupası'nda dördüncü kez üstüste şampiyon olan takım Türkiye Şampiyonası'na katılmaya hak kazandı. 15-19 Mart 1961 tarihlerinde düzenlenen Türkiye Şampiyonası'nda İstanbul şampiyonu Galatasaray'a 45-50, İstanbul ikincisi Darüşşafaka'ya 54-59 yenilen takım iddiasını kaybetti. Kalan maçlarında Harbokulu'nu 67-54, Altınordu'yu 87-61 yendi, Modaspor'a 84-87 yenilse de Darüşşafaka'nın birinci olduğu Şampiyonada averajla Türkiye üçüncüsü oldu. Kadın basketbol takımı ise İÜSBK'nın ardından İstanbul ikincisi oldu, ancak maddi sıkıntılardan ötürü Türkiye Şampiyonası’na katılmama kararı aldı. Genç erkek takımı ise 4 Şubat 1961'de Galatasaray’a 62-71 yenilerek İstanbul ikincisi oldu.
Voleybol
Takım 10 takımlı ligde ilk kez güçlü bir kadroyla mücadele etti. 12 Kasım 1960 tarihinde Galatasaray'a 3-1 yenilerek liderlik mücadelesinden uzaklaştı. İkinci yarıda Darüşşafaka'ya 3-1 yenilerek üçüncülük yarışından da uzaklaşan sarı-lacivertliler 18 maçta 12 galibiyet ve 44/25’lik set averajıyla ligi dördüncü bitirdi. Manisa'da düzenlenen Federasyon Kupası'nda Darüşşafaka'nın gerisinde ikinci olan takım tarihinde ilk kez Türkiye Şampiyonasına gitme şansını kaçırdı. Takım 30 Ocak-1 Şubat 1961 tarihlerinde düzenlenen Payidar Dobra Dörtlü Turnuvası'nda İsrail şampiyonu Hapoel Ein-Shemer'i İTÜ ve Rasimpaşa’yı yenerek şampiyon oldu. En son 1954 yılında Türkiye şampiyonu olan genç erkek takımı birkaç yıllık aradan sonra aradan sonra İstanbul Ligi’ne katıldı. Kadın takımı bir yıl önce İstanbul Kadınlar
Ligi şampiyonluğunu kaptırdığı Galatasaray ile birincilik için yarıştı. İlk yarıdaki maçı 3-1 kazanan sarı-lacivertliler, ikinci yarıda da 12 Mart 1961’deki final mahiyetindeki maçta da ezeli rakibini 3-1 (13-15, 15-12, 15-12, 15-13) yendi ve şampiyonluk unvanını namağlup olarak geri aldı . 23-25 Mart 1961 tarihlerinde Ankara'da düzenlenen Türkiye Kadınlar
Şampiyonası'nda ise Ankara birincisi ve ikincisi Gazi Eğitim Enstitüsü ve Kolej takımlarını 3-0 yenmesine rağmen 24 Mart 1961'de Galatasaray'a 3-2 yenilerek 1956 yılından beri beş sezondur koruduğu Türkiye şampiyonluğunu kaybetti. Takım sezon içinde düzenlenen Payidar Dobra Uluslararası Dörtlü Turnuvası'nda ve Teşvik Turnuvası'nda da ikincilikte kaldı.
Şampiyonası'nda 26.764 puanla, Beşiktaş, Kurtuluş, İzmir Karantina, Jandarmagücü ve Deniz Harp Okulu takımlarını geride bırakarak yedinci kez Türkiye şampiyonluğunu kazandı. Kadınlar da 1958'den beri ellerinde tuttukları İstanbul şampiyonluğunu bir kez daha kazanırken 8 Temmuz 1961'de Türkiye şampiyonluğuna da ulaştılar. Yıldız erkekler ise İstanbul ve kros şampiyonu oldu.
Kürek
İstinye'deki denizcilik lokalinin yıkılmasından beri düzenli çalışma olanağı bulamayan sarı-lacivertli sporcular 1961 mevsiminde de geçmişteki büyük başarıları tekrarlamaktan uzak kaldılar. 11 Haziran 1961'deki Teşvik Yarışlarında 8 birincilik ve 1 ikincilikle sezona umutlu giren Fenerbahçe, daha sonra rakiplerinin gerisinde kaldı. Bunda elbette ki başta Galatasaray olmak üzere rakiplerinin Avrupa'dan modern (sarma tipi) futa getirtmeleri ve Fenerbahçe'nin eski (bindirme tipi) futalarla mücadeleye devam etmesiydi. Bu konuda 1961 yılında ilginç bir gelişme patlak verdi. Türk sporuna destek amacıyla ithal edilen bu futaların gümrük bedellerini ödeyen Beden Terbiyesi Genel Müdürlüğü (BTGM), Bulgaristan'la yapılacak milli yarışlarda daha önce imzalanan anlaşmanın hükümleri gereği Galatasaray'dan tekneleri istedi, ancak Galatasaray BTGM'nin yardımıyla alınan tekneleri milli karşılaşmalar için vermeyi reddetti . Ancak daha sonra Galatasaray'a ceza verilmesi gündeme gelince, sarı-kırmızılı kulüp futalarını milli takıma vermeye razı oldu. 6 Ağustos 1961'de düzenlenen İstanbul
Kürek
Şampiyonası'nda yeni teknelerine rağmen Galatasaray bir yıl önce şampiyonluğu kaptırdığı Anadoluhisarı'ndan bu sene de birinciliği kurtaramazken, Fenerbahçe 3 ikincilik ve 3 üçüncülük alarak bu iki takımın ardından İstanbul üçüncüsü oldu. Fenerbahçeli sporcular 14 Ağustos 1961'de İstanbul'da düzenlenen Türkiye Şampiyonası'na ise katılmadılar.
Yüzme
Yüzme
takımı Dumlupınar Yarışları'nda birincilik kazanırken, İstanbul Şampiyonası'nda da genç bayanlar kategorisinde şampiyon oldu. Kule ve tramplen atlama branşı ise Muammer Çolpan ile İstanbul ikinciliğine ulaştı.
Boks
13-14 Ağustos 1960’ta düzenlenen Küçük Kemal Kupası’nda Fenerbahçe ikinci oldu. Fenerbahçe, 14-15 Aralık 1960’taki İstanbul Şampiyonası’nda sadece ağır sıklette Aydın Demir ile tek altın madalya aldı ve 3 puanla üçüncü oldu. 24-26 Aralık 1960’ta Adana’da düzenlenen Türkiye Büyükler Ferdi
Boks
Şampiyonası’nda ise 63,5 kiloda Şükrü Has altın, 67 kiloda ise İlhami Evrensel gümüş madalya kazandı.
Masatenisi
Nazım Arpacı, Kazım Osmanlı ve Ümit Paker'den kurulu masatenisi takımı 8 yıl aradan sonra Beyoğluspor'un üstünlüğüne son vererek İstanbul şampiyonu oldu. Bölgelerarası düzenlenen Türkiye Şampiyonası'nda bölge şampiyonu olarak İstanbul'u temsil etti ve tarihindeki ilk Türkiye şampiyonluğunu kazandı .
Yelken
6-7 Kasım 1961'de Kalamış'ta düzenlenen Türkiye Şampiyonası'nda Zekai Tüker Finn sınıfında birinci oldu. İzmir'de 22-26 Ekim 1961'de düzenlenen Pirat-Şarpi Türkiye Şampiyonası’nda ise pirat serbest sınıfında Bozkurt Suveren-Zafer Atçı ekibi üçüncülüğe ulaştı. 1961 sezonunundaki muhtelif yarışlarda ise, snipe yerli sınıfında Sümer Demir, Necdet, Mehmet ve Yılmaz, finn sınıfında Koray Oğuztaş, pirat Avrupa sınıfında Zekai Tüker ve Celal, pirat yerli sınıfında Cahit ve Güney birincilik kazanan Fenerbahçeli yelkenciler oldular.
