Türkçe Bilgi logo TürkçeBilgi

Poisson-Boltzmann Denklemi

Kısaca: Poisson-Boltzmann denklemi elektrolitler içindeki moleküller arasındaki elektrostatik etkileşimleri açıklayan diferansiyel denklemlere denir. Bu denklem aynı zamanda Gouy-Chapman çift tabaka (arayüzlü)'nın matematiksel temelidir; ilk olarak Gouy tarafından tasarlanmış daha sonra Chapman tarafından 1913te tamamlanmıştır. Bu denklem moleküler dinamikte ve biofizikte önemlidir, zira bu denklem, çözücünün yapılar üzerindeki etkilerine ve farklı iyonik güçlere sahip çözeltilerdeki proteinlerin, DNAnı ...devamı ☟

Poisson-Boltzmann denklemi elektrolitler içindeki moleküller arasındaki elektrostatik etkileşimleri açıklayan diferansiyel denklemlere denir. Bu denklem aynı zamanda Gouy-Chapman çift tabaka 'nın matematiksel temelidir; ilk olarak Gouy tarafından tasarlanmış daha sonra Chapman tarafından 1913te tamamlanmıştır. Bu denklem moleküler dinamikte ve biofizikte önemlidir, zira bu denklem, çözücünün yapılar üzerindeki etkilerine ve farklı iyonik güçlere sahip çözeltilerdeki proteinlerin, DNAnın, RNAnın ve diğer moleküllerin etkileşimlerine yaklaşım yapılmasında ve de zımni çözünmeyi modellemede kullanılmaktadır. Genellikle Poisson-Boltmann denklemini kompleks sistelerde çözmek zordur, fakat birçok bilgisayar programı onu numerik olarak çözmek için geliştirilmiştir. Bu denklem cgs şu şekilde yazılır : : \vec\cdot\left[1] = -4\pi\rho^(\vec) - 4\pi\sum_c_^z_ q \lambda(\vec) \cdot \exp \left[2] veya mks : : \vec\cdot\left[3] = -\rho^(\vec) - \sum_c_^z_ q \lambda(\vec) \cdot \exp \left[4] burada \vec\cdot diverjansa , \epsilon(\vec) konuma bağlı dielektriğe, \vec \Psi(\vec) elektrostatik potansiyelin gradyanına, \rho^(\vec) çözünenin yük yoğunluğuna, c_^ çözeltiden sonsuz uzaklıktaki iyon i yoğunluğuna, z_ iyonun yüküne, q protonun yüküne, k_B Boltzmann sabitine T sıcaklığa, ve \lambda(\vec) çözeltide r konumunun iyonlara konuma bağlı erişilebilirliğini belirleyen bir faktöre tekamül etmektedir. Eğerki potansiyel kT'ye kıyasla büyük değilse, denklemin daha verimli çözülebilmesi için doğrusallaşırılabilir, ki bu da Debye-Hückel denklemini ortaya çıkarır. Ayrıca bakınız * DelPhi: bugün bedava yazılım olarak dağıtılan protein için Poisson-Boltzmann çözücüsü Dış bağlantılar * Adaptive Poisson–Boltzmann Solver * Zap - A Poisson–Boltzmann electrostatics solver. * MIBPB Matched Interface & Boundary based Poisson–Boltzmann solver * CHARMM-GUI: PBEQ Solver

Kaynaklar

Vikipedi

Bu konuda henüz görüş yok.
Görüş/mesaj gerekli.
Markdown kullanılabilir.