Türkçe Bilgi logo TürkçeBilgi

Helikaz

Kısaca: Helikazlar tüm canlılar için hayatî önem taşıyan bir enzim sınıfıdır. Nükleik asitlerin fosfodiester omurgası üzerinde hareket ederek birbirlerine hidrojen bağlarıyla bağlanmış nükleik asit ipliklerini (DNA'nın, RNA'nın veya RNA-DNA hibritlerinin) ayrıştırır. Bunun için ATP hidrolizinden açığa çıkan enerjiyi kullanır. ...devamı ☟

Helikaz
Helikaz

Helikazlar tüm canlılar için hayati önem taşıyan bir enzim sınıfıdır. Nükleik asitlerin fosfodiester omurgası üzerinde hareket ederek birbirlerine hidrojen bağlarıyla bağlanmış nükleik asit ipliklerini (DNA'nın, RNA'nın veya RNA-DNA hibritlerinin) ayrıştırır. Bunun için ATP hidrolizinden açığa çıkan enerjiyi kullanır. İşlev Çoğu hücresel işlev (DNA ikileşmesi, transkripsiyon, DNA tamiri, ribozom biyongenezi gibi) nükleik asit ipliklerinin ayrışmasını gerektirir. DNA ikili sarmal'ının veya kendi kendisiyle baz eşleşmesi yapmış RNA moleküllerinin ipliklerinin ayrışmasında genelde helikazlar görev alır. Bu süreçte ATP hidrolizinden kaynaklanan enerji kullanılır. Pekçok helikaz vardır (E. coli'de kesin bilinen 14, insanda 24) bunların çokluğu, iplik ayrışmasının gerekli olduğu süreçlerin çeşitliliğinin bir sonucudur. Helikazlar bir iplik üzerinde her bir halikaz için farklı olabilecek bir doğrultu ve süreçleme ile adım adım ilerlerler. Helikazlar farklı yapılara ve oligomerleşme hallerine sahiptir. DnaB-benzeri helikazlar simit şekilli heksamer (altılı) DNA'yı çözmelerine karşın, başka enzimler monomer veya dimer olarak çalışırlar. Helikazlar ikileşme çatalının genişlemesi için pasif şekilde beklemezler, aktif olarak çatalın açılmasını sağlarlar. Hücre içinde helikazlarla beraber çalışan yardımcı proteinler sayesinde DNA'nın çözülmesi helikazın tek başına çalışmasına kıyasla çok daha hızlı olabilir. Helikaz kodlayan bir gendeki mutasyonlar Werner sendromuna yol açar, bu bozuklukta erken yaşlanma görülür. Yapısal özellikler Helikazlar belli derecede amino asit dizi benzerliği gösterirler; ortak dizi motiflerine sahiptirler. Bu dizilerin ATP hidrolizi ve nükleik asit iplik üzerinde ilerleme ile ilgilidir. Amino asit dizisinin değişken kısmı ise her helikazın kendine has özellkileri ile ilgilidir. Tanımlanmış helikaz motiflerine dayanarak herhangi bir proteine muhtemel bir helikaz etkinliği addetmek mümkündür ama bir motifin varlığı bir proteinin helikaz olduğunu teyid etmeye yetmez. Korunmuş dizi motifleri enzimler arasında evrimsel homolojiyi desteklerler. Helikaz motiflerin varlığına ve biçimine dayanılarak, helikazlar 4 üst aileye ve 2 küçük aileye ayrılmıştır. Aşağıda bunların ayrıntıları verilmiştir. Üst aileler * Üst aile I: UvrD (E. coli, DNA tamiri), Rep (E. coli, DNA ikileşmesi), PcrA (Staphylococcus aureus, rekombinasyon), Dda (bacteriofaj T4, ikileşme başlatımı), RecD (E. coli, rekombinasyonlu tamir), TraI (F plasmidi, konjügasyonlu DNA transferi). * Üst aile II: RecQ (E. coli, DNA tamiri), eIF4A (ekmek mayası, RNA çevrimi), WRN (insan, DNA tamiri), NS3 (Hepatit C virüsü, ikileşme). TRCF (Mfd) (E.coli, transkripsiyon-tamir birleşimi). * Üst aile III: LTag (Simian Virüs 40, ikileşme), E1 (human papillomavirus, ikileşme), Rep (Adeno-ilişkili Virüs, ikileşme, viral bütünleşme, virion paketlemesi). * DnaB-benzeri aile: dnaB (E. coli, ikileşme), gp41 (bakteriofaj T4, DNA ikileşmesi),T7gp4 (bakteriofaj T7, DNA ikileşmesi). * Rho-benzeri aile: Rho (E. coli, transkripsiyon sonlanması). Bu üst ailelerin tüm olasıl helikazları kapsamamaktadır. Örneğin XPB ve ERCC2 yukarıda belirtilen ailerin hiç birine ait değildir.

Kaynaklar

Vikipedi

Bu konuda henüz görüş yok.
Görüş/mesaj gerekli.
Markdown kullanılabilir.

Replikasyon çatalı
2 yıl önce

meydana gelir. İki DNA zincirini bir arada tutan hidrojen bağlarını kıran helikaz enzimi tarafından oluşturulur. Öncelikle sentezin orijin noktasında oluşur...

İkileşme çatalı, DNA ikileşmesi, Hidrojen bağı, Kromozom, Nükleotit, Replizom, Replikasyon orjini, Replikon, Yarı saklı çoğalma, DNA polimeraz, Helikaz
DNA yanlış eşleşme tamiri
6 yıl önce

içine alacak şekilde tek zincir kesişi yapar (endonükleaz aktivite). DNA helikaz kesilen parçayı uzaklaştırır. Tüm ökaryotik hücreler MER için yapısal ve...

DNA yanlış eşleşme tamiri, DNA, DNA tamiri, Enzim, Genetik, Mutasyon, Protein, Replikasyon, í–karyot, DNA helikaz, DNA polimeraz
Hidrolaz
2 yıl önce

peptit bağları hariç EC 3.6: asit anhidritder (asit anhidrit hidrolazlar, helikaz ve GTPazlar dahil olmak üzere) EC 3.7: karbon-karbon bağları EC 3.8: halojenür...

Hidrolaz, Biyokimya, Enzim, Hidroliz, Kimya, Kimyasal bağ, Taslak
DNA onarımı
6 yıl önce

gelmektedir ve alt birimlerden XPB 3'→5' ve XPD 5'→3' helikaz aktivitelerine sahiptir. Helikaz aktiviteleri nedeniyle, TFIIH DNA zincirinin 20-30 nükleotidlik...
Enzim listesi
2 yıl önce

peptit bağları hariç EC 3.6: asit anhidritder (asit anhidrit hidrolazlar, helikaz ve GTPazlar dahil olmak üzere) EC 3.7: karbon-karbon bağları EC 3.8: halojenür...
Homolog rekombinasyon
2 yıl önce

DNA'ya bağlanınca, RecB ve RecD altbirimleri, ATP hidrolizi ile yürüyen helikaz etkinliği sayesinde, birbirine sarılı DNA ikilisini çözmeye başlar. Bu...
DNA replikasyonu
6 yıl önce

sentez ile en iyi şekilde açıklanabilir. DNA DNA polimeraz Kinaz DNA ligaz Helikaz Primaz Telomeraz Okazaki parçaları ^ Berg JM, Tymoczko JL, Stryer L, Clarke...
DNA Polimeraz
2 yıl önce

iki baz RNA'dır, ve primaz adlı başka bir enzim tarafından üretilirler. Helikaz denen bir enzim ise, DNA'nın ikili sarmalını ters yönde burarak gevşetir...